Kabupaten Paniai adalah salah satu kabupaten di provinsi Papua, Indonesia. Ibukota kabupaten ini terletak di Enarotali. Kabupaten Paniai memiliki luas wilayah sebesar 18.104,64 km dan berpenduduk sebanyak 238.715 jiwa (2006). Kabupaten ini terbagi dalam 21 kecamatan dan 276 kampung atau desa. Lataknya berada di pedalaman pada ketinggian 1.700 meter di atas permukaan laut.
Paniai pada zaman Belanda disebut Wissel Meeren, sesuai dengan nama tiga danau yang terletak sekitar pusat kota Enarotali. Danau ini ditemukan oleh seorang pilot berkebangsaan Belanda, Wissel, tahun 1938. (danau dalam bahasa Belanda = meer ; jamak= meeren)Karena Wissel yang menemukan danau-danau tersebut maka kemudian dikenal dengan nama Wisselmeeren.Sejak saat itu masyarakat Paniai mulai berinteraksi dengan dunia luar.