Emil Frey (24 Oktober 1838 - 24 Desember 1922) adalah politikus Swiss dan Anggota Dewan Federal Swiss (1890-1897).
Ia terpilih sebagai anggota Dewan Federal Swiss pada 11 Desember 1890 hingga 31 Maret 1897. Ia berafiliasi dengan Partai Demokrat Bebas Swiss.
Selama masa jabatannya, ia pernah memimpin Departemen Militer.
Ia menjabat Presiden Konfederasi pada 1894.